适用《民法典》及其司法解释。具体来说，主要是《民法典》总则编以及合同编的内容。对于某些有名合同，还可以适用对应的司法解释。如：建设工程施工合同纠纷，就可以适用《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》。

一、施工合同与备案合同如果不一致怎么办

1、施工合同与备案合同如果不一致以已经备案了的合同为准

相关法律规定：《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》

第二十一条规定：“当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。”

当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。

2、备案的流程

（1）网上申报。上首先承包人登陆政府门户网站，然后在建设工程合同备案管理信息系统进行合同备案网上申报，根据合同的具体性质、内容在对应的合同备案表中填写相关信息，打印出带条型码的合同备案表。

（2）办理备案手续。合同当事人携带相关资料到合同备案管理机构办理合同备案手续。

（3）正式签发合同备案表。备案机构审核合同当事人提供的合同备案资料，符合要求的，加盖合同备案专用章。

二、建设工程施工合同是专属管辖吗

建设工程合同纠纷适用合同地域管辖而非专属管辖。

最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第二十四条建设工程施工合同纠纷以施工行为地为合同履行地。

本条是关于建设工程施工合同地域管辖的程序性规定。明确规定建设工程施工合同纠纷案件不适用专属管辖。

按照一般地域管辖原则，建设工程施工合同纠纷案件应当以施工行为地为合同履行地的，由施工行为地或者被告所在地人民法院管辖。

三、垫资的法律依据

对于建设工程施工合同中的垫资条款，人民法院按照《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》，规定了以下的处理原则：

第一，发包人、承包人在建设工程施工合同垫资条款中约定对垫支和垫资利息有约定的，按照当事人的约定处理，但约定的利息计算标准高于中国人民银行发布的同期贷款利息的部分除外；

第二，发包人、承包人对垫资在建设工程施工合同中没有约定的，转化为建设工程发包人对承包人的工程欠款，按照工程欠款处理；

第三，发包人、承包人对垫资利息没有约定的，则承包人无权主张利息，人民法院也不支持承包人的垫资利息的诉讼请求。