一、公司非法经营会有什么处罚

根据《刑法》第225条的规定，犯非法经营罪的，处5年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得1倍以上5倍以下罚金；情节特别严重的，处5年以上有期徒刑，并处违法所得1倍以上5倍以下罚金或者没收财产。

根据刑法第231条的规定，单位犯非法经营罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员按照上述法定刑判处刑罚。

本罪在主观上要求行为人必须是出于故意的，对于因不知其为非法而进行非法经营的，不认为构成本罪，而只能给予行为人以行政处罚。

根据以上规定，如果公司员工能够有证据证明自己不知情，或者没有参与到违法活动里，或者不知道自己的行为是违法的，可以不承担法律责任。

二、公司非法经营是不会处罚普通员工的

根据《刑法》规定，公司、企业、事业单位等也是可以犯非法经营罪的，同样需要承担相应的法律责任，但并不是，其所属的员工都要跟着承担法律责任。刑法规定，公司、企业、事业单位等，犯非法经营罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员追究刑事责任，该判刑的判刑，该罚款的罚款。

只要不是所在公司的直接主管非法经营事务的领导，也不是相关的销售人员的，不需要担忧会被追究法律责任。

公司非法经营会有什么处罚的法律依据：

《中华人民共和国刑法》第二百二十五条

【非法经营罪】违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产：

（一）未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品的；

（二）买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件的；

（三）未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务的，或者非法从事资金支付结算业务的；

（四）其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为。

《中华人民共和国刑法》第二百三十一条

单位犯本节第二百二十一条至第二百三十条规定之罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照本节各该条的规定处罚。