专利申请合同纠纷，可以通过调解方式解决。通常是纠纷双方约定一方或双方让步，消除其间存在的争议。调解一般是在第三人的参与下进行，在我国多为律师或专利行政管理机关参与调解。由于这种方式给争议双方制造了一种较缓和的气氛，大多数情况下也能顾全当事人的声誉，所以通常能为双方当事人所接受。实践中已创造了不少的先例。但是，由于这是一种诉讼外的调解，双方达成的调解协议不具有法律效力，而是靠当事人自觉履行。如果一方或双方当事人不履行调解协议，则无法请求强制执行。当事人对达成的调解协议反悔的，有权向人民法院提起诉讼。此外，调解也不是解决专利合同纠纷的必经程序。

一、合同中发生争议应当怎样处理

任何一种违约行为都有可能引起合同纠纷。对于房产合同纠纷，当事人可以通过下列途径解决：1、和解。和解是由争议各方根据合同约定的违约责任和各方实际情况，自行协商而不需要通过司法程序解决纠纷的方式。和解是房产纠纷常见的解决方式。但由于和解协议缺乏相关的法律约束力，延误了纠纷的有效解决的情况也是有存在。2、调解。调解是由争议各方选择信任的第三方居中，就合同争议进行调解处理。调解通常是以各方互谅互让为原则进行。但由于调解协议与和解协议一样不具有强制性效力，也使得纠纷的解决难尽人意。3、仲裁。仲裁指争议各方根据合同中的仲裁条款，或者纠纷发生以后达成的仲裁协议，将争议提交法定的仲裁机构，由仲裁机构依据仲裁规定居间进行居中调解，依法做出裁定的方式。4、诉讼。诉讼是解决房产合同争议的最后方式。是指人民法院根据争议双方的请求、事实和法律依据，依法做出裁判，藉此解决争议的方式。针对诉讼或仲裁关于权利救济：仲裁是一裁终局，在快捷方便同时，又失去了二审的监督作用。当然在法定情况下，当事人是可以向法院申请撤销仲裁裁决的。而诉讼本来就是二审终审，即使是发生了法律效力的判决，当事人还可以向上级法院申请再审，救济途径相对更广。

二、工程建设施工合同纠纷的解决途径

1、和解。和解是指当事人因合同发生纠纷时可以再行协商，在尊重双方利益的基础上，就争议的事项达成一致，从而解决纠纷的方式。和解是当事人自由选择的在自愿原则下解决台同纠纷的方式，而不是合同纠纷解决的必经程序。当事人也可以不经协商和解而直接选择其他解决纠纷的途径。

2、调解。凋解是指在第三人的主持下，通过运用说服教育等方法来解决当事人之间的合同纠纷。调解有两种方式一是人民调解委员会调解当事人发生合同纠纷，可以向纠纷当事人所在地或者纠纷发生地的人民调解委员会申请调解。二是行政调解。主要特指工商行政管理机关居中对合同当事人的纠纷进行调解。申请行政调解的纠纷必须具备以下条件：申请人必须是与本案有直接利害关系的当事人，有明确的被申请人、具体的调解请求和事实根据；符合工商行政管理机关受理案件范围的规定。但已经向人民法院起诉的或者已经向仲裁机构申请裁的。从及一方要求调解另一方不同意调解的，调解申请不于受理。双方当事人接受调解达成协议的，应当制作调解协议书，当事人即应当按照调解协议书履行各自的义务。由于调解协议书不具有法律强制力，一方当事人不履行的，对方当事人不能就此请求人民法院强制执行，但可以采用其他方式来解决争议。

3、仲裁。仲裁是指发生合同争议的双方当事人，根据争议发生前或发生后达成的仲裁协议，将纠纷提交仲裁机关进行裁决并解决纠纷的方式。仲裁具有准司法性质，仲裁机构作出的仲裁裁决具有法律效力，当事人应当履行。

4、诉讼。诉讼是指合同纠纷发生后，当事人如果没有仲裁协议，任何一方均可以向人民法院提起民事诉讼，请求人民法院对合同纠纷依法予以处理。这是解决合同纠纷的最常见方式。合同纠纷经人民法院审理并作出判决后，当事人对人民法院作出的发生法律效力的判决书，调解书必须履行，拒不履行的，另一方当事人可以申请人民法院强制执行。