根据最高人民检察院、公安部《关于经济犯罪案件追诉标准的规定》的规定，违法发行贷款罪的立案标准如下：1、个人违法发行贷款，直接经济损失金额在50万元以上2、公司违法发行贷款，直接经济损失金额在100万元以上。

违法发放贷款罪的司法认定

（一）罪与非罪的界限

违法发放贷款罪系行为犯或结果犯，即以侵害行为具备一定的情节或者发生一定的危害后果作为构成要件的犯罪。如果侵害行为未到达严重程度，则只能以一般违法行为进行处理。对于违法发放贷款行为之罪与非罪的区分，关键是从客观方面进行考察，主要包括以下三个方面：

1、行为人是否违反国家规定。行为人基于违反《商业银行法》《贷款通则》《贷款证管理办法》《信贷资金管理办法》《民法典》等等一切法律或行政法规有关信贷管理的规定而发放贷款，则构成犯罪，如果违反的只是所在单位内部规定，不能对其追究刑事责任。

2、所发放贷款数额是否巨大。如果未达到数额巨大的标准，则不构成本罪。

3、是否造成重大损失。如果未造成重大损失的，不能以本罪论处。2001年《全国法院审理金融犯罪案件工作座谈会纪要》中指出，银行或者其他金融机构工作人员违反法律、行政法规规定，向关系人以外的其他人发放贷款，造成50—100万元以上损失的，可以认定为造成重大损失；造成300—500万元以上损失的，可以认定为造成特别重大损失。

（二）此罪与彼罪的界限

1、违法发放贷款罪与玩忽职守罪的区别

玩忽职守罪是指国家机关工作人员违反职责规定，不履行或者不正确履行自己的职责义务，致使公共财产、国家和人民利益遭受重大损失的行为。《关于惩治破坏金融秩序犯罪的决定》实施以前，违法发放贷款犯罪行为是按照玩忽职守罪进行处罚的。经过国家对本罪立法的完善和对玩忽职守罪立法的修改，现在两罪存在明显的区别。

首先，二者侵犯的客体不同。前者侵犯的是国家的金融管理秩序；后者侵犯的是一般国家机关的正常管理活动。

其次，主观方面不同。本罪在主观上既可由过失也可由故意构成，而后者只能由过失构成。

再次，二者责任主体不同。前者的主体是中国经营贷款业务的金融机构及其工作人员；后者的主体是一般的国家工作人员，国家机关不能成为主体要件。

最后，二者客观方面表现不同。前者表现为玩忽职守或者滥用职权而非法发放贷款的行为，其造成的损失一般指经济损失；后者则只表现为玩忽职守的行为，其造成的损失可能是经济损失，也可能是人身伤亡，还可能是严重的政治影响等。

2、违法发放贷款罪与贷款诈骗罪的区别

贷款诈骗罪是指以非法占有为目的，采用虚构事实或隐瞒真相的方法，诈骗银行或者其他金融机构的贷款，数额较大的行为。两个罪名之间的区别在于：一是侵害的客体不同。前者侵害的是国家金融管理秩序，贷款诈骗罪还侵害公私财物的所有权；二是主观方面不同。贷款诈骗罪只能出于故意，并且具有非法占有目的；三是主体方面不同。单位不属于贷款诈骗罪的责任主体；四是客观方面不同。贷款诈骗罪只能是结果犯。

（三）对关系人的认定

《刑法》第一百八十六条第二款中向关系人发放贷款的中的关系人，包括两类，一是商业银行的内部人员，包括董事（部分除外）、监事、各级管理人员和信贷业务人员。二是与商业银行存在着某种内部关系的外部人员或组织，包括内部人员的近亲属、与内部人员及其近亲属有着投资或兼职关系的公司、企业和其他经济组织。

《中华人民共和国刑法》第一百八十六条银行或者其他金融机构的工作人员违反国家规定发放贷款，数额巨大或者造成重大损失的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处一万元以上十万元以下罚金；数额特别巨大或者造成特别重大损失的，处五年以上有期徒刑，并处二万元以上二十万元以下罚金。

银行或者其他金融机构的工作人员违反国家规定，向关系人发放贷款的，依照前款的规定从重处罚。

单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前两款的规定处罚。

关系人的范围，依照《中华人民共和国商业银行法》和有关金融法规确定。