商标转让合同纠纷应作以下处理：

1、一般由双方当事人协商解决；

2、协商不成的，可以向法院提起诉讼或者提交仲裁机构解决；

3、对于符合起诉条件的，法院应当在七日内立案，并通知当事人；不符合起诉条件的，应当在七日内作出裁定书，不予受理。

商标转让合同纠纷管辖法院是哪一个

根据《民事诉讼法》的规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。合同的双方当事人可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。当事人约定的履行地与实际履行地不一致的，以实际履行地为准。

因此，上述地点的中级人民法院或者有商标案件管辖权的基层人民法院有管辖权。对于合同责任与侵权责任竞合的商标案件，按照当事人选择的诉因来确定管辖法院。

转让注意事项

在实践中，大量的转让注册商标都是以合同方式转让注册的。

转让注册商标，需要依法履行一定的手续，经商标局核准后，转让注册方能生效。转让注册商标而不向商标局办理有关手续的，属于自行转让注册商标的行为，这种私自转让的行为将受到行政处罚，严重时还可能导致注册商标被撤销。

商标权转让在合同生效后，转让人在商标的注册有效地域内，不得再在与受让商标核定使用的商品或服务上或者类似的商品和服务上使用已转让的商标，否则就是侵犯了受让人的商标权。转让人如果要继续使用，必须与受让方签订商标使用许可合同，取得受让人的授权。

所以，商标权人转让其注册商标时，应当连同其在同一种或类似商品或服务上注册的其他相同或者近似商标起转让给同一受让人。这是为了防止出现在同一类商品或服务上存在不同生产者或服务者使用相同商标的混乱现象和消费者的误认。

在我们的现实生活当中，我们国家合同方面问题发生纠纷的话，那么一定要找准人民法院，这样的话才能够到法院来进行起诉，而跟管辖权有关的，一个非常重要的就是合同的履行地，合同履行地以协议或者是以实际履行为准。

《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十三条

人民法院应当保障当事人依照法律规定享有的起诉权利。对符合本法第一百一十九条的起诉，必须受理。符合起诉条件的，应当在七日内立案，并通知当事人；不符合起诉条件的，应当在七日内作出裁定书，不予受理；原告对裁定不服的，可以提起上诉。