合同纠纷仲裁程序有以下三个步骤：

1、申请，是指一方当事人根据合同仲裁条款或事后达成的仲裁协议，将发生的争议依法请求仲裁委员会进行仲裁的行为。

2、受理，是指仲裁机构对当事人的申请进行审查后，认为符合受理条件，决定立案进行仲裁的程序。受理是仲裁程序的开始，是仲裁机构开始行使管辖权的标志。

3、开庭和裁决。

开庭是仲裁庭在双方当事人和其他仲裁参与人参加下，对仲裁请求进行实体审理和裁决的活动。开庭是仲裁活动的实质阶段。其目的是查清事实、分清是非、正确适用法律、确认当事人之间的权利义务关系。裁决是指仲裁庭在实体上对当事人权利义务作出裁断。裁决是仲裁审理的最终程序，一经作出即发生法律效力。

一、裁决不予执行的理由？

第一，当事人在合同中没有订立仲裁条款或者事后没有达成书面仲裁协议的。也就是说，仲裁以合同当事人的协议为前提。如果当事人在合同中没有订立仲裁条款，事后也无书面的仲裁协议，仲裁就没有根据，仲裁机构即使作出裁决，人民法院也不予执行。

第二，裁决的事项不属于仲裁协议的范围或者仲裁机构无权仲裁的。仲裁机构应当依照仲裁法规的规定和当事人仲裁协议的约定进行仲裁，其裁决才能有效。仲裁机构的裁决事项如果超出了当事人仲裁协议的范围，或者仲裁的事项不属于仲裁机构受案范围的，属于超越职权的行为。因此，即使仲裁机构作了裁决，法院也不能执行。

第三，仲裁组织和仲裁程序是仲裁工作正常进行的重要保证，应当依照有关规定进行。如果仲裁员与本案有关联，依法应当回避而未回避，或者对当事人未经过合法通知而予以缺席仲裁等，其作出的裁决不发生效力，因而人民法院可不执行该项裁决。

第四，认定事实的主要证据不足的。

第五，适用法律有错误的。仲裁裁决必须依法进行，必须正确适用法律。

第六，仲裁员在仲裁该案时有贪污受贿、枉法裁决行为的。仲裁员必须廉洁奉公，依法裁决，如果在仲裁案件中有贪污受贿、枉法裁决的行为，则是违法犯罪的行为，所作裁决必然是错误的，人民法院理所当然亦不予执行。

第七，在涉外仲裁中，被申请执行人没有得到指定的仲裁员或者进行仲裁程序的通知，或者由于其他不属于被申请人负责的原因未能陈述意见。如果被申请执行人没有得到指定仲裁员或者进行仲裁程序的通知，或者遭到了不可抗拒的事由未能到庭陈述的，该仲裁裁决不能执行。

第八，涉外仲裁中，仲裁庭的组成或者仲裁的程序与仲裁规则不符。

二、撤销仲裁裁决的期限

《仲裁法》第59条规定，当事人申请撤销裁决的，应当自收到裁决书之日起六个月内提出。第60条规定，人民法院应当在受理撤销裁决申请之日起两个月内作出撤销裁决或者驳回申请的裁定。

仲裁庭作出的仲裁裁决具有终局性，一经作出即约束双方当事人，不得随意更改。为了保证仲裁机构裁决的正确性和合法性，保护当事人的合法权益，使得错误的而又具有效力的裁决得到纠正，《仲裁法》赋予人院对仲裁裁决的司法监督权，允许人民法院在出现法定情形。

但是，撤销仲裁裁决应当由当事人提出申请，人民法院一般不主动行使司法监督权而撤销裁决（除非仲裁裁决违背社会公共利益）。我国《仲裁法》第五十八条规定，当事人提出证据证明仲裁裁决有下列情形之一的，可以向仲裁委员会的中级人民法院申请撤销裁决：

（1）没有仲裁协议的；

（2）裁决的事项不属于仲裁协议的范围或者仲裁委员会无权仲裁的；

（3）仲裁庭的组成或者仲裁的程序违反法定程序的；

（4）裁决所依据的证据是伪造的；

（5）对方当事人隐瞒了足以影响公正裁决的证据的；

（6）仲裁员在仲裁该案时有索贿受贿、徇私舞弊、枉法裁判行为的。

此外，《仲裁法》还对涉外仲裁的撤销裁决事项作出了这样的特别规定：“当事人提出证据证明涉外仲裁裁决有《》第二百六十条第一款规定的情形之一的，经人民法院组成合议庭审查核实，裁定撤销。”《民事诉讼法》规定的情形有：

（1）当事人在合同中没有订立仲裁条款或者事后没有达成书面仲裁协议的；

（2）当事人没有得到指定仲裁员或者进行仲裁程序的通知，或者由于其他不属于当事人负责的原因而未能陈述意见的；

（3）仲裁庭的组成或者仲裁的程序与仲裁规则不符的；

（4）裁决的事项不属于仲裁协议的范围或者仲裁机构无权仲裁的。

从上述规定可以看出，当事人申请撤销仲裁裁决一般限于仲裁程序上的缺陷或者仲裁员的不正当行为，对裁决实体问题错误申请撤销裁决有着非常严格的条件限制（对于涉外仲裁裁决，实体问题根本不能构成申请撤销裁决的理由）。并且，申请撤销仲裁裁决的当事人要承担裁决有法定撤销事由的举证责任。需要注意的是，《仲裁法》对当事人申请撤销裁决的期限作出了明确规定，即应当自收到裁决书之日起六个月内提出。超过此期限，人民法院则不再受理当事人撤销裁决的申请。因此，裁决具有法律规定可以撤销情形的，当事人一定要在法律规定的上述有效期限内向人民法院提出申请。