目前的信托基金资金运用方式主要为贷款，股权投资较少，而且有不断萎缩的趋势。即使在仅有的股权投资项目中，信托公司基本并不参与目标公司的具体经营管理，所采取各种控制措施，例如派驻董事，委任财务总监，修改章程等，目的是要防范资金风险。股权投资项目的结束方式主要依靠第三方购回股权，目标公司分红与清算的情形基本未曾出现，也不可能等待ipo。这种回购型股权投资属于变相的债权融资。股权投资之所以较少出现，因为该方式有致命缺陷，即在短期（1－2年）内第三方今后购回存在很大不确定性，退出渠道不畅，风险较大，信托公司也就不再愿意采用。信托期限较短，基本为1－2年。其实，我国居民的长期资金并不缺乏，用于养老、子女教育、婚嫁等储蓄十分可观，但造成－信托期限短的主要原因是：投资者期望短期内获取收益，对长期理财心存疑虑；信托公司的理财能力、品牌尚无法让投资者信服。由于信托合同数量的限制，信托公司为了募集足额资金，只得寻找企业机构客户，而企业机构客户的资金往往都是短期的。我国的社保基金理事会等大型机构虽然有长期资金，但目前不能购买信托基金。另外，贷款信托无法开发成长期理财品种。银监会不允许信托公司采用受益凭证方式发行，能够证明投资者对信托财产及其收益拥有权利的凭证就是信托合同。目前的规章对信托合同的内容、格式等规定比较原则化，因此信托合同属于非标准的契约，转让手续繁琐，流动性很差。各家信托公司仅负责本公司的信托基金的交易，没有全国性的集中交易场所。目前信托期限短，故流动性需求尚不明显；如果信托期限较长，在信托期间交易需求将变得迫切，流动性不足的问题将比较突出。这也是信托公司无法开发长期理财品种的原因之一。信托基金投入的项目数量较少，一般仅有一个，风险过于集中。受到信托合同数量200份限制，信＊融资规模相对有限，一个信托基金的资金量无法投向多个项目。而且，现阶段信托公司在一个信托基金中管理多个项目的能力也有限。无论发行规模的大小，目前信托公司、信托执行经理很少出资认购信托基金的部分份额。这样对业务人员缺乏制衡机制。业务人员开发信托项目的初衷可能主要是为了获取自己的业绩提成，存在冒险冲动，因此，业务人员、其所在信托公司与投资人三者之间存在信息不对称与利益冲突的可能。