1、性质不同

母公司是在国际商务中指以母国为基地，通过对外直接投资对海外经济实体进行有效控制的总公司。

控股股东是指其出资额占有限责任公司资本总额百分之五十以上或者其持有的股份占股份有限公司股本总额百分之五十以上的股东。

2、条件不同

母公司必须有一个或一个以上的子公司，即必须满足合并报表准则所规定的控制的要求，能够决定另一个企业的财务和经营政策，并能据以从另一个企业的经营活动中获取利益的权力。

控股股东条件是：在单独或者与他人一致行动时，可以选出半数以上的董事;可以行使公司30%以上的表决权或者可以控制公司30%以上表决权的行使;，持有公司30%以上的股份。

3、概念不同

母公司是拥有另一个公司一定比例以上的股份或通过协议方式能够对另一个公司实行实际控制的公司，具有法人资格，可以独立承担民事责任。

控股股东是依其出资额或者持有的股份所享有的表决权已足以对股东会、股东大会的决议产生重大影响的法人。

一、控股股东公司是不是就是母公司？

就是属于母公司；

母公司是在国际商务中以母国为基地，通过对外直接投资对海外经济实体进行有效控制的总公司。大多数跨国公司的母公司为一个国家的资本所建立，但在少数情况下也可能由两个或更多国家的资本联合建立。母公司作为整个跨国公司的决策中心，是在母国政府机构登记注册的法人组织，负责组织和管理跨国公司在海内外的全部生产经营活动。

根据公司在控制与被控制关系中所处地位的不同，可以划分为母公司和子公司。实际控制其他公司的公司是母公司，受其他公司实际控制的公司是子公司。它们都具有法人资格。

二、母公司的条件

母公司是有一个或一个以上子公司的企业。从母公司的定义可以看出母公司要求同时具备两个条件：

一是必须有一个或一个以上的子公司，即必须满足合并报表准则所规定的控制的要求，能够决定另一个企业的财务和经营政策，并能据以从另一个企业的经营活动中获取利益的权力。母公司可以只控制一个子公司，也可以同时控制多个子公司。

二是母公司可以是企业，如《公司法》所规范的股份有限公司、有限责任公司，也可以是主体，如非企业形式的、但形成会计主体的其他组织，如基金等。