对于补充侦查的案件，检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。

具有下列情形之一，不能确定犯罪嫌疑人构成犯罪和需要追究刑事责任的，属于证据不足，不符合起诉条件：

（1）据以定罪的证据存在疑问，无法查证属实的；

（2）犯罪构成要件事实缺乏必要的证据予以证明的：

（3）据以定罪的证据之间的矛盾不能合理排除的；

（4）根据得出的结论具有其他可能性的。

刑事诉讼法中对不起诉的情况进行了明确的规定，一般情况下，如果证据不足或者双方已经达成和解并就相关赔偿问题取得一致意见的情况下，司法机关可以不予起诉。需要注意的是，如果当事人违反了相关法律导致需要追究刑事责任的，那么即使达成和解也需要进行起诉来追究相关责任。

证据不足不起诉后侦查继续吗？

存疑不起诉后侦查机关需要继续侦查该案件，由于存疑的首要原因就是证据不足，导致检察院的职员在审查案件时发现了疑点。任何的刑事案件都必须要在掌握了充分的证据的前提之下才能审结案件的，故此对于存疑的情形一般不会起诉。

存疑不起诉后侦查机关需要继续侦查该案件。检察机关行驶国家检察权的重要形式，具有相当的社会影响，为防止检察机关对此权利的滥用，必须对此进行监督。在刑事诉讼法律规范中对人民检察院的不起诉决定的监督方式主要有被害人和被不起诉人的监督、侦查机关的监督、上级检察机关监督、和本级检察机关自行监督。

检察院对案件进行审查后，在证据不足的情况下作出不起诉决定的，依据具体的案件可以作出以下的处理：

1、如果是公安机关移送的案件，公安机关认为检察机关不起诉决定有错误的，是可以申请复议的，如果检察机关复议后仍然不起诉的，公安机关可以在收到复议决定书后，连同相关的材料向上级检察机关申请复核。

2、如果公安机关认同检察机关不起诉决定的，犯罪嫌疑人被公安机关采取强制措施的，公安机关应该立即解除刑事强制措施，释放在押的当事人。

3、公安机关收到不起诉决定后，公安机关认为要追究刑事责任的，是可以继续对案件进行侦查的，在收集到新证据的情况下，可以再将案件材料移送到检察机关，请求检察机关提起公诉。

《刑事诉讼法》第十六条

有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：

（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；

（二）犯罪已过追诉时效期限的；

（三）经特赦令免除刑罚的；

（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；

（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；

（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。