服务期协议和劳动合同的区别如下：

1、主体资格不同。劳动合同的主体只能一方是法人或组织，即用人单位，服务协议则必须是劳动者个人，劳动合同的主体不能同时都是自然人；

劳务合同的主体双方当事人可以同时都是法人、组织、公民，也可以是公民与法人、组织；

2、主体性质及其关系不同。劳动合同的双方主体间不仅存在财产关系即经济关系，还存在着人身关系，即行政隶属关系。但服务协议的双方主体之间只存在财产关系，即经济关系，彼此之间无从属性，不存在行政隶属关系，劳动者提供劳务服务，用人单位支付劳务报酬，各自独立、地位平等；

3、主体的待遇不同。劳动关系中的劳动者除获得工资报酬外，还有保险、福利待遇等；而服务协议中的自然人，一般只获得劳动报酬；

4、报酬的性质不同。因劳动合同的履行而产生的劳动报酬，具有分配性质，体现按劳分配的原则，不完全和不直接随市场供求情况变动，其支付形式往往特定化为一种持续、定期的工资支付；因服务协议而取得的劳动报酬，按等价有偿的市场原则支付，完全由双方当事人协商确定，是商品价格的一次性支付，商品价格是与市场的变化直接联系的。

签订服务期协议时应注意的问题

1、关于服务期适用范围的限制

服务期是在用人单位为劳动者提供特殊待遇后，劳动者承诺在用人单位必须服务的期限，用人单位与劳动者约定服务期的前提是，用人单位已经为劳动者提供了特殊待遇，这里的特殊待遇主要指用人单位为劳动者提供了专业培训，并不是说用人单位对其任何招用人员均可以约定服务期的。

《劳动合同法》第22条明确规定：“用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。”否则，该服务期的约定可能就是违法无效的。

2、关于服务期违约金数额的限制

根据民法的公平原则、等价有偿以及意思自治原则，服务期作为用人单位与劳动者意思自治的结果，在用人单位提供了相应的专业培训，并支付了相关费用后，劳动者就应该按照双方约定的期限，为用人单位提供服务，为防止劳动者在享受培训后，拒不提供服务，应当允许用人单位与劳动者约定违反服务期的法律责任。因此，用人单位与劳动者关于服务期违约金的约定应是受到法律保护的。

但相对于劳动者而言，毕竟用人单位处于强势地位，为保证双方权利义务的公平、平等，有必要对双方约定的违约金进行必要的限制，不能超过一定得数额。

《劳动合同法》第22条第二款规定“违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。”需要注意的是，劳动者如果在提供了一定年限的服务后，违反服务期约定的，在计算违约金时，应扣除已经履行年限应分摊的违约金数额。

3、服务期期限超过劳动合同期限时，劳动合同期限应顺延至服务期届满

劳动合同期限是劳动合同确定的，用人单位与劳动者享有、履行各自劳动权利义务关系的期限，劳动合同期限作为劳动合同的法定内容之一，在该期限内，用人单位与劳动者双方的权利义务关系一般是明确的、具体的，在劳动合同期限内，劳动者可以按照法律规定，依法解除劳动合同，且不需要承担违约责任。

而服务期限主要是劳动者应当为用人单位提供服务的期限，其重点是保证劳动者在用人单位提供服务需达到约定年限，保证用人单位能收回其对劳动者的投资，在服务期内，劳动者与用人单位的权利义务，一般是按照双方劳动合同的约定来确定的。且服务期的期限利益是属于用人单位的，劳动者是不能任意解除、终止服务期的。

综上，用人单位与劳动者约定服务期限为五年的，劳动者违约后，违约金一般是由双方签订的服务协议确定，但不能超过用人单位支付的培训费。

《中华人民共和国劳动合同法》第二十二条用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。

劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。