申请撤销行政许可的程序主要包括：利害关系人主动提出问题;行政机关进行立案;调查取证;作出撤销行政许可的事前通知;组织听证会;做出撤销决定。

(一)启动

1、依利害关系人的请求启动。《行政许可法》第六十九条规定，作出行政许可决定的行政机关或者其上级行政机关，根据利害关系人的请求，可以撤销行政许可。

2、行政机关监督检查中发现。在执法检查中，或者是群众举报，作出行政许可决定的行政机关或者其上级行政机关，发现行政机关违法作出行政许可决定，必须启动撤销该行政许可的程序。

(二)立案

行政机关启动行政许可的撤销程序后，行政机关的负责人必须指派两名以上的工作人员承办该案，承办该行政许可决定的审批人员实行回避制。

(三)调查取证

主要收集两类证据，一类是事实类，另一类是法律法规类，收集撤销的依据。

(四)调查终结

承办人员在收集到相关证据后，应写出调查终结报告，调查终结报告的内容应包括：当事人的基本情况、主要事实、处理依据、处理决定建议等。

(五)撤销行政许可预先告知

撤销行政许可涉及被许可人的重大利益，在作出撤销决定前，应当预先告知该行政许可的被许可人有陈述、申辩的权利，并告知被许可人享有要求听证的权利。

(六)听证

听证程序应当参照《行政许可法》第四章第四节听证有关条款，保障被许可人的听证权利。听证按照下列程序进行：

1、行政机关应当于举行听证的七日前将举行听证的时间、地点通知申请人、利害关系人，必要时予以公告;

2、听证应当公开举行;

3、行政机关应当指定审查该行政许可申请的工作人员以外的人员为听证主持人，申请人、利害关系人认为主持人与该行政许可事项有直接利害关系的，有权申请回避;

4、举行听证时，审查该行政许可申请的工作人员应当提供审查意见的证据、理由，申请人、利害关系人可以提出证据，并进行申辩和质证;

5、听证应当制作笔录，听证笔录应当交听证参加人确认无误后签字或者盖章。

行政机关应当根据听证笔录，作出行政许可决定。

(七)作出决定

作出撤销行政许可决定，向当事人、利害关系人送达。撤销行政许可决定书应当包括：撤销的理由、依据、并告知当事人和利害关系人自接到撤销决定书之日起60日内可向上级行政机关申请行政复议或在六个月内直接向人民法院提起行政诉讼。

需要注意的是：依照《行政许可法》第六十九条第一款的规定撤销行政许可，被许可人的合法权益受到损害的，行政机关应当依法给予赔偿。依照第六十九条第二款的规定撤销行政许可的，被许可人基于行政许可取得的利益不受保护。

如果撤销行政许可程序存在不当，导致被许可人的合法权益受到损害的，行政机关应当依法给予赔偿。通常情况下，如果我们要进行行政许可撤销的话是可以要求进行听证的，听证包括很多的范围，如果是一些法律法规实施的过程中，应当进行听证的话需要主动举行听证。