个人隐私亲子鉴定和司法亲子鉴定之间存在明显的区别，这些区别主要体现在用途、法律效力、办理流程、样本采集方式以及隐私保护等方面。

一、用途不同

个人隐私亲子鉴定：主要用于个人私下了解与孩子的亲生关系，解决个人疑虑或作为参考证明。它只用于个人了解与使用，申请人只想自己知道亲子鉴定的结果，不打算将鉴定报告用于其他事情。

司法亲子鉴定：具有法律效力，其鉴定结论可提供给法院、公安机关、公证处以及出入境管理处等司法机构使用。它通常用于户籍申请、出生医学证明发放、离异、养育纠纷案件、继承遗产案、出国留学、香港移居、弃儿收养、少年儿童错抱案、贩卖儿童案、奸污致孕案等需要法律认可的场合。

二、法律效力不同

个人隐私亲子鉴定：仅能作为个人了解参考用，鉴定报告不具备司法法律效力，不能作为落户、迁户口等司法用途，但可作为证据材料。

司法亲子鉴定：不但能够作为个人了解参考，还能够用于司法部门的司法主要用途，如落户、迁户口、申请办理出生医学证明、公证等司法用途。司法亲子鉴定报告里边的內容有基本情况、检案引言、检测全过程、检测結果、dna数据表明、鉴定结论以及被鉴定人的电子照片、身份证件、司法鉴定许可证书、司法鉴定人从业证以及司法鉴定人的签名和鉴定机构的盖章等。

三、办理流程不同

个人隐私亲子鉴定：办理流程相对方便快捷，可以选择到鉴定机构现场采样办理，或者由鉴定机构安排工作人员上门采样，也可以由委托人自行采集样本邮寄到鉴定机构办理。它允许匿名申请，只需为自己选择一个代号即可，保护隐私性。

司法亲子鉴定：受理程序相对严谨，以确保鉴定结果的准确、真实、公正、有效。被鉴定人必须亲自到鉴定机构办理实名委托，并提供本人真实有效的身份证件。鉴定中心会认真核对被鉴定人身份信息并现场拍照，亲子鉴定样本必须由本中心工作人员采集，必要时须有公证人员在场。

四、样本采集方式不同

个人隐私亲子鉴定：被鉴定人可以提供多种样本，包括血液（各种载体上的血痕／血斑）、唾液斑、口腔拭子、毛发、烟头、牙刷等。

司法亲子鉴定：一般现场采集样本，并且通常只能使用血痕或口腔拭子（口腔拭子通常仅对于小孩或不方便采集的个体适用）。