一、农民工欠薪保证金缴纳比例最高为多少

农民工欠薪保证金缴纳比例最高为薪资的3%，《农民工工资保证金管理暂行办法》第十条建筑施工单位按下列标准预存农民工工资保证金：

(一)工程合同价款在100(不含100万)万元以下的，按工程合同价款的5%预存;工程合同价款在100万以上至200万元的(含100万元)，按工程合同价款的4%预存;工程合同价款在200万元至500(含200万)万元的，按工程合同价款的3%预存;工程合同价款在500万元以上的(含500万)，按工程合同价款的2%预存;

(二)上年未完工的在建工程，建筑施工企业按剩余施施工量和相应比例补存工资保证金;

(三)包工不包料的工程按工程合同价款的8%预存。

第十三条已存入工资保证金的建筑施工企业，确因资金周转困难无法按时支付农民工工资，劳动保障行政部门可动用该企业的工资保证金支付，建筑施工企业应在动用之日起10日内按动用金额的200%补存。

第十四条建筑施工企业不按时支付农民工工资、数额超过专户存储工资保证金数额，劳动保障行政部门可动用该企业的工资保证金支付，并会同建设、公安等行政部门强制企业补足差额部分。建筑施工企业应在动用之日起10日内按动用金额的200%补存工资保证金。

可见，农民工工资保证金比例根据工程合同价款的不同有所不同，比例主要有2%、3%、4%、5%。

二、对于恶意拖欠农民工工资有以下几种做法:

1、最简单的方法是电话投诉到当地劳动执法监察大队，他们会依据《劳动保障监察条例》依法对用人单位进行监督检查，并责令其支付拖欠的工资。

2、还可依据劳动合同法第三十条的规定，用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。

3、最有效的是直接到当地劳动行政部门申请劳动仲裁(不收费，不用律师)，通过劳动仲裁下达的裁决书，向单位索赔，如果还不赔，可申请法院强制执行。

4、如果劳动仲裁不予受理或者仲裁不公，还可以在15天内向法院提起民事诉讼，直接通过法院判决执行。

5、按上述途径索取工资的同时，还可依据劳动合同法第八十五条的规定，要求单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向你加付赔偿金。

为了更快的使得更多的民事主体可以脱贫，我国法律明确规定了工程建设单位不拖欠农民工的薪资，即使是为了使得工程的质量更加的有保障，也只能是由建设施工单位，支付一定比例的质保金给工程的发包方，由此，农民工若是遇到薪资被扣除的情形时，是可以起诉的。