一、第二次退回补充侦查九个月还未起诉是否合理?

第二次退回补充侦查九个月还未起诉理论上是不合理的，辩护人可以申请变更强制措施。

我国《刑事诉讼法》第一百七十二条规定：人民检察院对于公安机关移送起诉的案件，应当在1个月以内作出决定，重大复杂的案件，可以延长半个月。人民检察院审查起诉的案件，改变管辖的，从改变后的人民检察院收到案件之日起计算审查起诉期限。另外，《刑事诉讼法》第一百四十条规定，对于补充侦查的案件，应当在1个月以内补充侦查完毕，补充侦查以2次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。

一个案件一般情况下在审查起诉阶段审限最长为：1.5月+1月+1.5月+1月+1.5月=6.5月。但是如果是改变管辖或上报案件，是不是“从改变后的人民检察院收到案件之日起计算审查起诉期限”，又有6.5月的审查期限呢?答案却是否定的，根据《人民检察院刑事诉讼规则》第二百七十一条的规定，“改变管辖前后退回补充侦查的次数总共不得超过两次”，所以改变管辖(包括上报)的案件退补也最多不超过2次，因此改变管辖(包括上报)的案件审限最长为1.5+6.5=8个月。

二、审查起诉的内容

(1)犯罪嫌疑人身份状况是否清楚，包括姓名、性别、国籍、出生年月日、职业和单位等;

(2)犯罪事实、情节是否清楚;认定犯罪性质和罪名是否正确、有无法定的从重、从轻、减轻或者免除处罚的情节;共同犯罪案件的犯罪嫌疑人在犯罪活动中的责任认定是否恰当;

(3)证据材料是否随案移送，不移送的证据的清单、复制件、照片或者其他证明文件是否随案移送;

(4)证据是否确实、充分;

(5)有无遗漏罪行和其他应当追究刑事责任的人;

(6)是否属于不应当追究刑事责任的;

(7)有无附带民事诉讼;对于国家财产、集体财产受到损失，是否需要由人民检察院提起附带民事诉讼;

(8)采取的强制措施是否适当;

(9)审查活动是否合法;

(10)与犯罪有关的财产及其孳息是否扣押、冻结并妥善保管，以共核查。对被害人合法财产的返还和违禁品或者不宜长期保存的物品的处理是否妥当，移送的证明文件是否完备。

一般的刑事案件不可能在第2次被退回补充侦查以后，9个月的时间检察院还没有做出撤案或起诉的决定，而且程序法明确规定补充侦查的时间不能延长，所以，如果说人民检察院审查起诉的时间就有8个月了的话，涉嫌构成超期羁押。