专利证书印花税（5元）不是专利申请的官费，是国家知识产权局代收了给税务局的。

如果不交专利证书印花税，不影响专利的授权，但是国家知识产权局不发专利证书。

具体文件

《国家税务局关于专利证书印花税代征办法的批复》

国税函发（1991）1405号

北京市税务局：

你局京税三字（1991）48号《关于对完税专利证书以加印代扣印花税专用章标记代替贴花问题的请示》和你局所属海淀区分局与中国专利局所立《委托代征印花税协议书》均收悉。现批复如下：

1、根据印花税暂行条例规定，对各种专利证书可以由你局委托中国专利局在核发时统一代征印花税。

2、同意你局自一九九一年一月一日起，对统一代征印花税的专利证书，在其右上角处加印中国专利局代扣印花税专用章戳记，并在其右下角处注明本证书印花税5元已缴纳字样，作为完税标志。

3、采取委托代征办法后，由你局负责对专利证书印花税缴纳办法具体解释，并会同中国专利局对完税的专利证书底册及编号进行管理。

一、印花税征税范围

现行印花税只对《印花税暂行条例》列举的凭证征收，没有列举的凭证不征税。具体征税范围如下：

1、经济合同

税目税率表中列举了10大类合同。它们是：

（1）购销合同。

（2）加工承揽合同。

（3）建设工程勘察设计合同。

（4）建筑安装工程承包合同。

（5）财产租赁合同。

（6）货物运输合同。

（7）仓储保管合同。

（8）借款合同。

（9）财产保险合同。

（10）技术合同。

2、产权转移书据

产权转移即财产权利关系的变更行为，表现为产权主体发生变更。产权转移书据是在产权的买卖、交换、继承、赠与、分割等产权主体变更过程中，由产权出让人与受让人之间所订立的民事法律文书。

我国印花税税目中的产权转移书据包括财产所有权、版权、商标专用权、专利权、专有技术使用权共5项产权的转移书据。其中，财产所有权转移书据，是指经政府管理机关登记注册的不动产、动产所有权转移所书立的书据，包括股份制企业向社会公开发行的股票，因购买、继承、赠与所书立的产权转移书据。其他4项则属于无形资产的产权转移书据。

另外，土地使用权出让合同、土地使用权转让合同、商品房销售合同按照产权转移书据征收印花税。

二、哪些凭证进行印花税纳税申报

（1）合同或者具有合同性质的凭证：

购销合同、货物运输合同；

加工承揽合同、仓储保管合同；

建筑工程勘察设计合同、借款合同；

建筑安装工程承包合同、财产保险合同；

财产租赁合同技术合同等。

（2）产权转移书据。

（3）营业账簿：只对记载资金的营业账簿征收。

（4）权利、许可证照

（3）经财政部确定的其他凭证。