由于我国的市场经济还处于初级阶段，在企业兼并的实践过程中还存在着许多问题，应当引起足够的注意。从各地反映的情况看，从1989年下半年开始，企业兼并的势头有所减缓，这一情况具有普遍性。具体表现为企业兼并数量减少，跨地区兼并更为困难，兼并的形式也由多样化变为资产无偿划拨为主，有些省市出现了行政性的强行撮合。出现这种状况的原因是多样的，既有宏观形势变化带来的短期影响，也有政策不完善的因素，更主要的则是体制上的深层原因。目前，企业兼并中应注意的问题主要有：产权问题、劳动力问题、资产评估与国有资产增值问题、政府行为、隐形兼并问题、反不公平竞争问题等等。

1、产权问题企业兼并或企业产权交易是企业所有者的行为，国有企业的兼并或产权交易，是国有资产产权所有者或代表者的行为。国有企业现在名义上是法人，实际上只拥有经营权，企业的所有权是由政府有关部门掌握和行使的。这正是国有企业兼并必须经政府主管部门批准才能进行的原因。现行国有资产管理体制的主要问题是，政府的社会行政管理职能和国有资产所有权职能不分，国有资产所有权职能中的管理职能和资产经营职能不分；国有企业没有独立的法人财产，不是真正的法人实体。因此，企业要想真正进入兼并市场，迫切需要理顺产权关系，明确企业产权主体。

2、劳动力问题当前，我国企业兼并中被兼并企业的人员安置问题是最大的难题。这个难题的解决，无非是两条路：一是由兼并企业吸收；二是由社会吸收。为实现兼并的绩效，使市场化的企业兼并健康发展，人员安置问题主要应走社会消化的途径，所以社会保障制度必须健全。另外，在理论上，它的根子还是涉及到劳动力是不是商品的问题。我们讲的兼并是个全要素的市场，不仅是物的要素，也是人的要素市场。所以，必须解决劳动力是不是商品的问题。

3、资产评估与国有资产增值在企业兼并过程中，资产评估也是个突出的问题。大体来说，主要包括：

（1）资产评估的核定标准问题；

（2）资产评估的过程，政府干预过多，未按市场规律进行核算、等价评估与买卖；

（3）债权债务不认真清理，银行贷款得不到安全回收，兼并后留下许多后遗症，引起纠纷。

4、兼并中的政府行为问题企业兼并中所有的政府行为并非都是不必要的。问题是，目前兼并活动中政府的盲目干预行为，确实给企业兼并带来了一些负效应。政府干预企业，在计划体制下是司空见惯的。政府以财产所有者的身份，这样或那样地干预企业的日常经营活动，使企业很难摆脱作为政府机构的附属物的地位，不能完全自主经营；似乎企业没有＂婆婆＂管着，就无法迈步行走，而在层层＂婆婆＂的管制下，中国企业必然先天不足，长期不知市场为何物。这种＂兼并＂的弊端是很危险的。

5、隐性兼并中存在的问题在市场经济中，生产要素的流动与重组，使企业兼并出现了多种多样的表现形式。许多小企业、小公司，尤其是私营小企业之间的兼并买卖行为，没有任何法律依据，也未经任何主管部门批准，甚至不见诸于任何统计数字，从而形成了隐形兼并的市场。隐形兼并市场虽体现出一种企业间供需关系的迫切需求，但也的确存在着许多需要解决的问题，如企业隐形兼并的程序问题、合法性问题，等等。企业兼并是一项政策性很强、程序较复杂的工作，只有依法深人细致地操作，才能使其规范化。

6、不公平竞争问题这个问题，随着市场经济体制的建立，将会越来越突出；兼并有追求垄断市场的自发倾向。在中国企业兼并的实践中，当然也会出现这样的问题，特别是国有企业与其他所有制性质企业的不平等竞争；因此，也应考虑制定反垄断法，使企业在大市场中按公平、公正、法制的原则开展竞争。