如何避免土地征收中的非法操作宪法修正案从根本制度上确立了土地征收与补偿制度，但到目前为止，对土地征收的范围、原则、程序、补偿标准和分配等问题还没有统一明确的规定。在具体操作中，地方政府部门要明确征地范围，编制征地程序，根据区域情况制定征地补偿标准和分配原则。基于现行土地征收制度的弊端，有必要进行制度改革和创新。本文通过对现行土地征收制度的法律经济学分析，针对实践过程中反映出来的种种弊端，提出了相应的政策建议。首先，以法律的形式明确征地范围、程序、补偿标准和分配原则，避免政府部门在征地过程中的违规操作。其次，针对农民在征地中的各种损失，细化补偿费的分类，提高补偿标准，合理保护被征地农民的权益。另外，在土地征收过程中，要加强土地执法监督，增加土地使用权的无形交易成本，防止土地使用权的无形交易，加大法律法规对土地使用权的约束；以提高土地利用效率在征地过程中，要公开征地信息，召开征地听证会，通过多种方式将农民纳入征地决策体系，以减少征地过程中的交易成本。根据《土地管理法》，土地出让必须严格程序，符合土地利用总体规划，并根据征地性质（基本农田或一般农田）和需求面积逐级报批。然而，地方政府在地方利益最大化的前提下奉行招商引资、优先建设的战略，这与大规模征地必须报国家批准的刚性约束直接冲突。在这种利益驱动下，地方政府开始以发展地方经济为借口，甚至以“发展是硬道理”为由，无视国家土地利用规划和环境保护的要求，实施“项目跟着领导走，规划跟随项目，超越审批权限出让土地”。

一些地方政府纵容甚至操纵违法用地，未经批准擅自设立、扩建开发区，以租代征，擅自调整土地利用总体规划，非法占用基本农田。清华大学土地研究组从国土资源部了解到的信息显示，在地方政府违法批地、涉及政府的案件中，违法主体占80%，违法用地主体占80%。但地方政府违法批地的新特点是违法案件数量明显减少，但总面积明显增加，呈现出由西向北梯度转移的趋势。违法占地主要有两种形式：一种是大量经营企业，特别是房地产企业，为谋取土地升值的潜在利益，违法占地、囤积大量土地。第二，国家开发区占地面积。目前，中国有6800多个工业园区。2003年，国家对各类开发区进行了改组，但一些地方以“产业基地”、“产业密集区”的名义变相设立“开发区”招商引资，一些被取消的开发区通过更名恢复活力。一些区县“开发区”采取与国家级、省级开发区“挂靠”的方式，争取更大的发展空间。主要有两种情况：一种是工业项目征收土地的“低价”协议转让。一些地方政府为了吸引更多的项目和投资，违反“协议出让土地”的管理办法，以“零地价”甚至“负地价”的价格出让土地。随着一些产业项目向中西部地区转移，一些西部地方政府在没有规划的情况下盲目签订协议，承诺为开发商提供大量开发用地。一些协议甚至提供了40-50平方公里的土地。因此，大量土地资源被少数企业垄断，造成国有土地资产流失。2007年9月28日，国土资源部发布了《国有建设用地招拍挂使用权管理条例》（国土资源部令[2007]39号），对国有建设用地使用权“招拍挂”出让范围作出了明确规定，挂牌出让的期限、出让价款的支付和国有建设用地使用证的颁发，避免协议损失造成土地出让的制度性损害。二是商业、旅游、娱乐、金融、服务业、商品房等六类商业用地违规“分批缴纳”土地出让金。2002年5月9日，国土资源部发布《国有土地使用权招标拍卖挂牌出让规定》（国土资源部令第11号），其中明确规定“受让人按照出让合同的规定缴纳全部出让金后，应当依法申请土地登记，取得土地使用权证书，取得土地使用权”。但在实际操作过程中，不少地方通过土地工程分期付款方式取得建设用地使用权证。开发商可以用有限的资金利用多个项目，并将风险转移给金融机构。