1.固定资产的核算

现行会计制度中事业单位固定资产只核算账面原值，这样的核算方式有许多弊端：(1)价值背离，固定资产账面价值与净值随时间的推移相差越来越大。(2)虚增净资产，以账面原值核算固定基金虚增了净资产。(3)修购基金按收入而不是按固定资产的折旧提取，修购基金的提取数额取决于单位当期实现事业收入，经营收入的多少，造成自身收入实现较少的单位固定资产损耗无法真正得到补偿。(4)成本不完整，固定资产不计提折旧，折旧数不能在资产负债表中得到体现，从而人为地降低了取得相应收入的成本，虚增了盈余。

因此，对会计报表使用者容易产生误导，不利于报表使用者正确解读会计报表。

2.对外投资的核算

为了更准确地反映单位长期投资情况，企业会计准则对长期股权投资采取了成本法和权益法两种核算方法，当投资企业对被投资企业具有控制、共同控制或重大影响时，长期股权投资应采用权益法核算。

3.应收账款的核算

事业单位应收账款一般不计提坏账，当这些债权确定无法收回的时候，一般都采用直接转销法，借记“事业支出(经营支出)”，贷记“应收账款”等。但是确定这些债权无法收回往往是几年后的事情，因此在确定之前这些无法收回的应收账款逐年挂帐，虚夸了流动资产总额，容易误导报表使用者。

4.无形资产的核算

事业单位尤其是科研院所长期以来普遍存在的“重有形，轻无形”观念，缺乏对无形资产的认识，科研成果的产生耗损了单位的设备及人员费用，属于职务发明，但对无形资产管理的不足造成了无形资产的流失和浪费，无法准确反映总体经济资源水平，包括物资资源和非物资资源，不利于对整体资产的正确评估。

5.缺少现金流量报表

企业单位核算的基础是权责发生制，事业单位核算的基础采用收付实现制，从这点看来，现金流量指标在事业单位发挥的作用大于企业单位，但是偏偏是企业单位编制现金流量表，而事业单位不编制该表。事业单位也需要掌握货币资金的运用和支付能力，防止出现资金紧缺。

一、完善事业单位财务会计报告

事业单位财务会计报告是反映事业单位财务状况和收支情况的书面文件，是财政部门和上级单位了解情况、掌握政策、指导单位预算执行工作的重要资料，也是编制下年度单位财务收支计划的基础。笔者认为，事业单位财务会计报告应在如下四个方面进行完善。

1.改进会计科目的核算

改进会计科目的核算方法，使会计报表的财务数据更能真实地反映事业单位各项经济活动的实际，如对固定资产计提折旧，在资产负债表中的“固定资产”项目下，增设“固定资产原值”、“累计折旧”和“固定资产净值”项目，以反映固定资产的新旧程度。

2.引入现金流量表

参考企业现金流量表准则的基本原理，结合事业单位的实际情况编制内部

报表——事业单位现金流量表，反映事业单位一定期间的现金流入和流出的整体情况，反映这些资金的变动原因。

3.加强对会计报表附注的说明

在执行事业单位会计制度的情况下，对现阶段难以用货币计量的信息及不稳定的特殊信息进行披露，以便财务报告的使用者对单位进行更为全面的了解和分析。

4.强化财务报告审计

事业单位也可委托中介机构对年终财务报告进行审计，以现行财务制度和有关政策规定为依据，对重点指标进行政策性审核，对报告编制的正确性和真实性进行规范性审核，从而提高单位资金使用效率，堵塞日常工作中的漏洞、防止腐败、对建立健全内部控制制度起到积极的作用。