离婚时有两个孩子的，法院会根据最有利于子女和双方实际情况，对两个孩子的抚养权进行判决。孩子如果是哺乳期或未满两周岁的，原则上会将抚养权判给母亲，如果孩子过了两周岁则根据谁的综合条件更有利于孩子健康成长对抚养权进行判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。不直接抚养子女的一方应当按时支付孩子抚养费。

离婚时两个孩子如何判？

原则上来说是一人一个，法院也是从社会角度来考虑这个事情的。当然，如果夫妻双方都表示不想让两个孩子分开，那么这种情况下，两个孩子完全判给一个人的可能性就会大增了。离婚两个孩子一般都是一方一个。但子女抚养的问题，法院具有很大的自由裁量权，这意味着哪一方能够说服法官，法官最终的判决就倾向于哪一方。

1、夫妻双方就孩子抚养问题协商一致，法院按照双方当事人的意思出具判决书或者调解书；

2、如果双方不能协商一致，法院通常会按照一人抚养一个子女的惯例进行判决（2个孩子的离婚类案件，法院判决不是绝对化的一人抚养一个，在离婚普遍存在争孩子抚养权的情况下，如无其它特殊情况，夫妻二人一人抚养一个是一个相对折中的处理方案，可以一定程度上的平衡离婚夫妻的心理，更易化解离婚夫妻双方在子女抚养问题上的争议）；在子女抚养的问题，法官具有较大的自由裁量权，因此将2个子女都判归一人抚养的情况也属正常。

3、判决抚养的时候法院会参考孩子的年龄，性别等因素进行判决，通常情况下，两周岁以内的子女原则上女方抚养，两周岁到十周岁之间的子女法院会按照有利子女成长的原则判决，十周岁以上的子女可以征求孩子意见。

《民法典》

1、2周岁以下的子女，一般随母方生活。母方有下列情形之一的，可随父方生活：

（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；

（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；

（3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。

2、父母双方协议2周岁以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许。

3、对2周岁以上未成年的子女，父方和母方均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑：

（1）已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的；

（2）子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的；

（3）无其他子女，而另一方有其他子女的；

（4）子女随其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的。

4、父方与母方抚养子女的条件基本相同，双方均要求子女与其共同生活，但子女单独随祖父母或外祖父母共同生活多年，且祖父母或外祖父母要求并且有能力帮助子女照顾孙子女或外孙子女的，可作为子女随父或母生活的优先条件予以考虑。

5、父母双方对10周岁以上的未成年子女随父或随母生活发生争执的，应考虑该子女的意见。

6、在有利于保护子女利益的前提下，父母双方协议轮流抚养子女的，可予准许。

父母与子女的关系不会因父母离婚而消除。离婚后，无论孩子是由父亲还是母亲直接抚养，仍然是父母双方的孩子。原则上，两岁以下儿童由母亲直接抚养。法律尊重当事人的意愿。首先，父母协商确定两个孩子的监护权。

《民法典》第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。