对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。我国法律规定，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：

（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；

（二）犯罪已过追诉时效期限的；

（三）经特赦令免除刑罚的；

（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；

（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；

（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。

检察院退侦材料也会一并退回公安机关吗

检察院退侦的时候关于案件的所有材料也都会退回公安机关的。

人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。对于补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。退回补充侦的原因可能是侦查机关（部门）没有完成侦查阶段的任务。

根据《人民检察院刑事诉讼规则》的规定，结合办案实际，实体性内容主要有：

1、主要犯罪事实不清、主要证据之间存在矛盾的；

2、犯罪构成要件欠缺的；

3、主要情节未予查实的；

4、遗漏重要犯罪事实及应追究刑事责任的同案犯罪嫌疑人的；

5、其他对定罪量刑有重要意义的事实尚未查清的。

《刑事诉讼法》第一百七十一条，人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料，认为可能存在本法第五十四条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明，人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。

对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕，补充侦查以二次为限，补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。