自诉案件没有被告真实身份的，并不影响案件的受理，可以提交相关证据后由司法机关调查取证时进行身份认定，最后进行判决。根据最高人民法院关于适用《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百八十一条人民法院对提起公诉的案件审查后，应当按照下列情形分别处理：

(一)属于告诉才处理的案件，应当退回人民检察院，并告知被害人有权提起自诉；

(二)不属于本院管辖或者被告人不在案的，应当退回人民检察院；

(三)不符合前条第二项至第八项规定之一，需要补充材料的，应当通知人民检察院在三日内补送；

(四)依照刑事诉讼法第一百九十五条第三项规定宣告被告人无罪后，人民检察院根据新的事实、证据重新起诉的，应当依法受理；

(五)依照本解释第二百四十二条规定裁定准许撤诉的案件，没有新的事实、证据，重新起诉的，应当退回人民检察院；

(六)符合刑事诉讼法第十五条第二项至第六项规定情形的，应当裁定终止审理或者退回人民检察院；

(七)被告人真实身份不明，但符合刑事诉讼法第一百五十八条第二款规定的，应当依法受理。

一、自诉案件包括哪些案件

(1)告诉才处理的案件；即规定的侮辱、诽谤案，暴力干涉婚姻自由案，虐待案以及侵占案。对于这些案件，只有被害人或者在被害人因受强制、威吓无法告诉的，人民检察院和被害人的近亲属提起告诉时，人民法院才予以受理；

(2)被害人有证据证明的轻微刑事案件。包括：故意伤害案(轻伤)，重婚案，遗弃案，妨碍通信自由案，非法侵入他人住宅案，生产销售伪劣商品案件(严重危害社会秩序和国家利益的除外)，侵犯案件(严重危害社会秩序和国家利益的除外)，以及属于刑法分则第4章、第5章规定的，对被告人可以判处3年以下刑罚的其他轻微刑事案件。

(3)被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身权利、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件。在审理自诉案件过程中，如果发现被告人还犯有必须由人民检察院提起公诉的罪行，则应将新发现的罪行另案移送有管辖权的公安机关或者人民检察院处理。