员工申请工伤认定的流程如下：

（一）员工向工伤保险部门提出申请，并提交相关材料；

（二）审核并受理；

（三）作出工伤认定的决定。

一、申请工伤认定的材料有哪些

提出工伤认定申请应当提交以下材料：

（一）职工个人的工伤认定申请书；

（二）受伤害职工的有效身份证明；

（三）劳动合同文本复印件或者与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的有效证明材料；

（四）用人单位事故调查报告书（个人申报的不必提供）；

（五）两人以上的证人证言；

（六）医疗机构出具的受伤后诊断证明书、初诊病历、住院病历，属职业病的提供合法有效的职业病诊断证明书或鉴定书。

（七）用人单位的营业执照副本或者工商行政管理部门出具的查询证明；

属于下列情形之一的，还应当提供以下相关证明材料：

1、工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害死亡或工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害死亡的，应提交有关部门出具的死亡证明书及事故调查报告书；

2、因履行工作职责受到暴力等意外伤害的，提交公安机关证明、人民法院的判决书或者其他有效证明；

3、因工外出期间，由于工作原因受到伤害的，提交公安机关证明或其它有效证明；发生事故下落不明要求认定因工死亡的，提交人民法院宣告死亡的结论；

4、由于机动车事故引起的伤亡事故，提交公安交通管理部门的交通事故认定书或相关处理证明；

5、在工作时间和工作岗位，突发疾病死亡或者在48小时之内经抢救无效死亡的，提交医疗机构的抢救和死亡证明；

6、属于抢险救灾等维护国家利益、公共利益活动中受到伤害的，按照法律法规规定，提交事发地县级以上有关部门出具的有效证明；

7、属于因战、因公负伤致残的转业、复员军人，旧伤复发的，提交民政部门颁发的《革命伤残军人证》以及劳动能力鉴定委员会对旧伤复发的确认证明；

8、直系亲属代表伤亡职工提出工伤认定申请的，提交有效的直系亲属关系证明；

9、工会组织代表伤亡职工提出工伤认定申请的，提交工会介绍信，办理人身份证明。

二、工伤认定对公司有什么影响吗

工伤认定对公司来说，如果确认工伤后，部分医药费就有工伤保险付了，但是一旦定级，企业要承担不少的费用，一旦定级后，如果该员工辞职，则单位要承担相应的伤残补助金和就业补助金，具体标准查看工伤条例。根据《工伤保险条例》规定，职工被认定为工伤后，可向用人单位主张下列损害赔偿项目：

（一）住院伙食补助费：单位按照因公出差伙食补助标准的70%发住院伙食补助费；

（二）医疗费：按实际支出的费用计算；

（三）停工工资：工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗的，继续享受工伤医疗待遇；

（四）护理费：生活不能自理的工伤职工在停工留薪期需要护理的，由所在单位负责。