确认股权纠纷有诉讼时效，诉讼时效为三年。

根据相关法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。

诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护；有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

一、公司股权确认纠纷的几种情况及判断标准

1、自然人、法人或者其他组织向人民法院主张确认其享有公司股权的，以合法方式取得的证明或者章程、股东名册、工商登记的记载来判断。

2、股东可以要求公司履行签发记载义务。

有限责任公司出资人履行出资义务或者股权受让人受让股权之后，公司未向其签发出资证明书或者未将其记载于公司股东名册的，股东可以向人民法院提起诉讼，请求公司履行签发记载义务。

3、原则上股东有权请求公司交付股票，但是上市公司的股票除外。

股份有限公司公司成立后，履行出资义务的股东，有权请求公司交付股票；公司不予交付的，股东可以向人民法院提起诉讼，请求公司履行交付义务。

但是，通过证券交易市场购买上市股份有限公司股份而成为股东者，其股东身份可以股票交易记录予以证明，其起诉请求公司交付股票的，人民法院不予支持

二、股权确认纠纷诉讼费收取标准是什么

案件受理费分别按照下列标准交纳：

财产案件根据诉讼请求的金额或者价额，按照下列比例分段累计交纳：

1、不超过1万元的，每件交纳50元；

2、超过1万元至10万元的部分，按照2．5％交纳；

3、超过10万元至20万元的部分，按照2％交纳；

4、超过20万元至50万元的部分，按照1．5％交纳；

5、超过50万元至100万元的部分，按照1％交纳；

6、超过100万元至200万元的部分，按照0．9％交纳；

7、超过200万元至500万元的部分，按照0．8％交纳；

8、超过500万元至1000万元的部分，按照0．7％交纳；

9、超过1000万元至2000万元的部分，按照0．6％交纳；

10、超过2000万元的部分，按照0．5％交纳。