不会，如果刑事拘留三个月没有判刑，以无罪进行释放的话，则不会留下案底。一般刑事拘留不会超过二个月，只有对重大嫌疑分子才会延长拘留时间，但最长不会超过三十七天。同时，一旦被起诉并且被判刑的话，则会留下案底。

刑事拘留是公安机构、人民检察院对直接受理的案件，在侦查过程中，遇到法定的紧急情况时，对于现行犯或者重大嫌疑分子所采取的临时剥夺其人身自由的强制方法。刑事拘留的结果不必然构成犯罪，对重大嫌疑分子经拘留期间的调查，排除犯罪嫌疑，不构成犯罪的，予以释放，发给释放证明，此种情况下，撤销刑事案件，不构成犯罪必然不会留下案底。但若经公安机关侦查，经人民检察院批准逮捕，并最终经人民法院判决有罪，则刑事拘留30天的结果会留下案底。

一、刑事拘留的程序是什么？

(一)拘留的决定

公安机构依法需要拘留犯罪嫌疑人的，由承办单位填写《呈请拘留报告书》，由县级以上公安机构负责人批准，签发《拘留证》，然后由提请批准拘留的单位负责执行。

人民检察院决定拘留的案件，应当由办案人员提出意见、部门负责人审核、检察长决定。决定拘留的案件，人民检察院应当将拘留的决定书送交公安机构，由公安机构负责执行。

(二)拘留的执行

公安机构执行拘留时，必须出示拘留证，并责令被拘留人在拘留证上签名、按指印。被拘留人如果抗拒拘留，执行人员有权使用强制方法，包括使用戒具。拘留后，除有碍侦查或者无法通知的情形以外，决定拘留的部门应当把拘留的原因和羁押的处所，在24小时以内，通知被拘留人的家属或者他的所在单位。

公安机构在异地执行拘留的时候，应当通知被拘留人所在地的公安机构，被拘留人所在地的公安机构应当予以配合。

(三)拘留的期限

公安机构对被拘留的人，认为需要逮捕的，应当在拘留后的三日以内，提请人民检察院审查批准。在特殊情况下，提请审查批准的时间可以延长一日至四日。

对于流窜作案、多次作案、结伙作案的重大嫌疑分子，提请审查批准的时间可以延长至三十日。

人民检察院应当自接到公安机构提请批准逮捕书后的七日以内，作出批准逮捕或者不批准逮捕的决定。人民检察院不批准逮捕的，公安机构应当在接到通知后立即释放，并且将执行情况及时通知人民检察院。对于需要继续侦查，并且符合取保候审、监视居住条件的，依法取保候审或者监视居住。