根据《土地增值税暂行条例》的规定，对于转让国有土地使用权、地上建筑物及其附着物并取得收入的单位和个人需要按其所取得的增值额缴纳土地增值税。目前依据《国家税务总局关于土地增值税一些具体问题规定的通知》(财税[1995]48号)的规定，涉及投资业务的土地增值税缴纳按以下原则处理：

(1)对于以房地产进行投资、联营的，投资、联营的一方以土地(房地产)作价入股进行投资或作为联营条件，将房地产转让到所投资、联营的企业中时，暂免征收土地增值税。

(2)对投资、联营企业将上述房地产再转让的，应征收土地增值税。

一、股权转让增值部分需要交企业所得税吗

转让股权不征收增值税。股东为个人的征收个人所得税，是企业的，转让所得并入所得额征收企业所得税。

无论是企业或个人，有签合同的，均需根据合同额征收印花税。根据规定，在股权转让中，单位、个人承受企业股权，企业的土地、房屋权属不发生转移，不征契税；对以土地、房屋权属作价入股或作为出资投入企业的，征收契税。

国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物权属转移要征土地增值税。个人转让股权，按财产转让所得缴纳个人所得税，税率为百分之二十，可扣除买价和相关的税费；企业转让股权，股权转让收益应并入企业的应纳税所得计算缴纳企业所得税。

纯土地资产的公司，全部股权一次性全部转让，应当缴纳土地增值税；不能作为投资形式规避增值税。改变原以房地产进行投资或者联营方式的出资不用缴纳土地增值税的规定，也需要缴纳税费。

综上，一般来说如果企业并不属于房地产企业，股权转让是不涉及土地增值税。

法律依据：《财政部、国家税务总局关于土地增值税若干问题的通知》（财税21号）

二、土地永久互换协议书怎么写可以不用缴纳增值税

1、土地永久互换协议书不管怎么写可以都需要缴纳增值税

根据《土地增值税暂行条例》第二条规定，转让国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物(以下简称转让房地产)并取得收入的单位和个人，为土地增值税的纳税义务人(以下简称纳税人)，应当依照本条例缴纳土地增值税。

2、转让建筑物有限产权或者永久使用权的，转让在建的建筑物或者构筑物所有权的，以及在转让建筑物或者构筑物时一并转让其所占土地的使用权的，按照销售不动产缴纳增值税。

3、土地使用者转让、抵押或置换土地，无论其是否取得了该土地的使用权属证书，无论其在转让、抵押或置换土地过程中是否与对方当事人办理了土地使用权属证书变更登记手续，只要土地使用者享有占有、使用、收益或处分该土地的权利，且有合同等证据表明其实质转让、抵押或置换了土地并取得了相应的经济利益，土地使用者及其对方当事人应当依照《税法》规定缴纳营业税、土地增值税和契税等相关税收。