司法鉴定机构决定不予受理鉴定委托的，应当向委托人说明理由，退还鉴定材料。

司法部《司法鉴定程序通则》的相关规定：

1、第十三条司法鉴定机构应当自收到委托之日起七个工作日内作出是否受理的决定。对于复杂、疑难或者特殊鉴定事项的委托，司法鉴定机构可以与委托人协商决定受理的时间。

2、第十六条司法鉴定机构决定受理鉴定委托的，应当与委托人签订司法鉴定委托书。司法鉴定委托书应当载明委托人名称、司法鉴定机构名称、委托鉴定事项、是否属于重新鉴定、鉴定用途、与鉴定有关的基本案情、鉴定材料的提供和退还、鉴定风险，以及双方商定的鉴定时限、鉴定费用及收取方式、双方权利义务等其他需要载明的事项。

3、第十七条司法鉴定机构决定不予受理鉴定委托的，应当向委托人说明理由，退还鉴定材料。

一、法院不受理司法鉴定申请该怎么办？

首先申请人需要明确申请司法鉴定的哪一步出了问题或者是哪一程序不符合规定，在司法鉴定程序的第二步我们可以看出司法鉴定机构收到委托书后，应对委托人的委托事项进行审核，并作出决定。如果不符合受理条件的，法院决定不予受理的，应当退回鉴定材料并向委托人说明明理由，此时可以根据鉴定材料上的鉴定结果以及退回理由重新准备材料。或者申请人可以和自己的代理律师进行沟通，向其寻求建议和帮助，按照律师给出的建议再按照申请程序进行再申请。

二、向司法鉴定机构住所地或者司法鉴定人执业机构所在地的县级以上司法行政机关投诉：

(一)超出登记的业务范围或者执业类别从事司法鉴定活动的；

(二)违反司法鉴定程序规则从事司法鉴定活动的；

(三)因不负责任给当事人合法权益造成损失的；

(四)违反司法鉴定收费管理规定的；

(五)司法鉴定机构无正当理由拒绝接受司法鉴定委托的；

(六)司法鉴定人私自接受司法鉴定委托的；

(七)司法鉴定人经人民法院通知，无正当理由拒绝出庭作证的；

(八)司法鉴定人故意做虚假鉴定的；

(九)其他违反司法鉴定管理规定的行为。

投诉人应当向司法行政机关提交书面投诉材料。投诉材料内容包括：被投诉人的姓名或者名称、投诉请求以及相关的事实和理由，并提供司法鉴定协议书、司法鉴定文书等相关的证明材料。投诉材料应当真实、合法、充分。投诉人委托他人代理投诉的，代理人应当提交投诉人的授权委托书和本人的身份证明。