公司依法申请工作居住证的流程是：携带工商营业执照或组织机构代码证书到当地劳保事务所窗口或居住证受理点开户，填写居住证申请表；开户后录入员工居住证办理信息，提交申报；根据申报人数缴纳办证费用，领取受理回执，等待领证。

公司申请工作居住证办理条件

工作居住证办理条件具体如下：

1、男性不超过60周岁；女性不超过55周岁；

2、重点支持符合城市功能定位和首都经济发展方向及产业规划要求单位；

3、申报时所在单位连续聘用6个月以上，且在此地工作2年以上；

4、有固定住所；

5、学士学位或中级职称；

6、最近连续6个月的个人所得税不低于150元／月。

工作居住证办理手续：

1、办理工作居住证的，申请人填写工作居住证申请表；

2、用人单位经办人将申请表及相关材料提交注册所在地人力资源与社会保障局；

3、注册所在地人力资源与社会保障局对材料进行审核，审核通过后将材料递交给市人力资源与社会保障局；

4、市人力资源与社会保障局审核通过后制作工作居住证，完成后转交注册所在地人力资源与社会保障局；

5、注册所在地人力资源与社会保障局将工作居住证转交用人单位。

法律依据：《居住证暂行条例》第九条

申领居住证，应当向居住地公安派出所或者受公安机关委托的社区服务机构提交本人居民身份证、本人相片以及居住地住址、就业、就读等证明材料。

居住地住址证明包括房屋租赁合同、房屋产权证明文件、购房合同或者房屋出租人、用人单位、就读学校出具的住宿证明等；就业证明包括工商营业执照、劳动合同、用人单位出具的劳动关系证明或者其他能够证明有合法稳定就业的材料等；就读证明包括学生证、就读学校出具的其他能够证明连续就读的材料等。

未满16周岁的未成年人和行动不便的老年人、残疾人等，可以由其监护人、近亲属代为申领居住证。监护人、近亲属代为办理的，应当提供委托人、代办人的合法有效身份证件。

申请人及相关证明材料出具人应当对本条规定的证明材料的真实性、合法性负责。

对申请材料不全的，公安派出所或者受公安机关委托的社区服务机构应当一次性告知申领人需要补充的材料。

对符合居住证办理条件的，公安机关应当自受理之日起15日内制作发放居住证；在偏远地区、交通不便的地区或者因特殊情况，不能按期制作发放居住证的，设区的市级以上地方人民政府在实施办法中可以对制作发放时限作出延长规定，但延长后最长不得超过30日。

《居住证暂行条例》第九条

申领居住证，应当向居住地公安派出所或者受公安机关委托的社区服务机构提交本人居民身份证、本人相片以及居住地住址、就业、就读等证明材料。未满16周岁的未成年人和行动不便的老年人、残疾人等，可以由其监护人、近亲属代为申领居住证。监护人、近亲属代为办理的，应当提供委托人、代办人的合法有效身份证件。申请人及相关证明材料出具人应当对本条规定的证明材料的真实性、合法性负责。对符合居住证办理条件的，公安机关应当自受理之日起15日内制作发放居住证；在偏远地区、交通不便的地区或者因特殊情况，不能按期制作发放居住证的，设区的市级以上地方人民政府在实施办法中可以对制作发放时限作出延长规定，但延长后最长不得超过30日。