无效。公司注销后其法人资格消失，所以签署的仲裁条款是无效的，但如果公司是以合并的方式注销的，公司的权利义务由合并后的公司承担，所以仲裁条款还有效，由合并后的公司承担。

一、公司合并的法律后果有哪些

公司合并后的法律后果具体表现为四个方面：

一、公司的解散。合并后必然有一个或者多个公司解散。

二、公司的变更。这里的变更是指法律上的变更，即公司合并后，存续的公司在注册资本等方面发生了重大变化，所以，该公司必须进行变更登记。

三、公司的设立。当公司采用新设合并后，原合并的公司全部消灭，成立了一个全新的公司，该公司就是新设合并的法律后果，新设立的公司应办理设立登记。

四、公司权利义务的概括承受。当公司合并后被合并公司的财产和债权、债务无条件地转移到新设立的公司或者存续的公司身上，由合并后的公司承继。

二、公司注销之后合同是否终止

公司注销后，并不影响合同的法律效力。如果公司注销前没有进行清算，注销后可起诉股东。合同在签订之时只要符合法律规定，由双方签字盖章即可生效，特殊约定的除外。公司现在注销意味着公司法律主体的灭失，但不能否定公司在注销前合法签订的合同。只能说在公司实体灭失后，若有公司的继受主体，由其继续承担合同权利义务，若无相关继受主体，公司所承受的合同的权利义务消灭。只要是在签订合同的时候，公司没有被注销，该合同就是有效的。如果在注销的时候公司已经被注销，那么该合同为无效合同，因为签订合同的主体是不存在的。公司在被注销之前，理应对于一切债权债务包括员工工资进行清算，而清算的工作之一是合同的清理。既然公司已经合法注销，那么其合同清理工作也应当完毕。

合同是否具有法律效力可以从以下几点考虑：

1、合同双方当事人为完全行为能力人;

2、合同系合同双方真实意思表示，不存在欺诈，胁迫，趁人之危等情形;

3、合同内容不能违反法律强制性规定;

4、合同内容不能侵害第三人合法权益。

三、原告公司注销了还能起诉吗

不可以。起诉时必须要有明确的原被告，如果原告公司注销的，那么，该案是无法起诉的，如果原告是被合并而注销的，此时，仍是可以的。企业注销登记后，法人资格终止，诉讼主体资格也随之不存在，不能再成为民事诉讼的当事人。