社保不是合作医疗，二者区别如下：

1、应用范围不同：医保卡的应用范围窄，只用于医疗保障范畴，而社保卡应用领域宽，可用于人力资源和社会保障等；

2、使用范围不同：医保卡只能在固定区域内使用，而社保卡执行全国统一标准，全国通用；

3、安全等级不同：医保卡安全等级较低，容易被复制，而社保卡安全等级较高；

4、概念不同：社会保障卡简称社保卡，由各地人力资源和社会保障部门面向社会发行，用于人力资源和社会保障各项业务领域的集成电路卡；

5、功能不同：社保卡不仅具有医保卡功能，还是办理各项社保业务的重要凭证，例如领取失业金等等。但医保卡仅限于医保功能，只能用来享受医保待遇；

6、发卡的地方不同。医疗保险卡由当地指定代理银行承办，而社会保障卡由各地人力资源和社会保障部门面向社会发行。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第六十条

用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。

无雇工的个体工商户、未在用人单位参加社会保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员，可以直接向社会保险费征收机构缴纳社会保险费。

第六十四条

社会保险基金包括基本养老保险基金、基本医疗保险基金、工伤保险基金、失业保险基金和生育保险基金。除基本医疗保险基金与生育保险基金合并建账及核算外，其他各项社会保险基金按照社会保险险种分别建账，分账核算。社会保险基金执行国家统一的会计制度。

社会保险基金专款专用，任何组织和个人不得侵占或者挪用。

基本养老保险基金逐步实行全国统筹，其他社会保险基金逐步实行省级统筹，具体时间、步骤由国务院规定。

交了社保还需要交农村合作医疗吗

参保社会保险后不需要继续交新型农村合作医疗。新型农村合作医疗是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度，最大的作用是看病就医时进行一定比例的报销。社会保险包括医疗保险、失业保险、生育保险、养老保险以及工伤保险五大种类，其中医疗保险的作用与新型农村合作医疗一致。而且社会保险中的医疗保险报销比例还高于新型农村合作医疗，两者不可重复报销。