公司债券，是指公司依照法定程序发行，约定在一定期限还本付息的有价证券，主体是公司。企业债券指企业依照法定程序发行，约定在一定期限内还本付息的有价证券，适用的主体是在中国境内具有法人资格的企业在境内发行的债券。

1、公司债券和企业债券的发行主体不同公司债券，顾名思义，是公司制企业发行的债券，包括股份有限公司和有限责任公司。企业债券，发行主体则是中央政府部门所属机构、国有独资企业或国有控股企业，相对来说，企业债券的发行主体范围比公司债券还要小的多。

2、债券募集得到的资金用途不同公司债券的发行，是为了公司的经营运作，募集而来的资金自然是会用于公司的投资、并购、技术升级等，公司债券募集的资金怎么用，是发债公司自己的内部事务，只要不违反法律法规规定即可。而企业债券募集而来的资金用途却诸多限制。企业债券募集的资金限制的主要用在固定资产投资和技术更新改造方面，而且是和政府审批的项目直接挂钩的。

3、发行公司债券和企业债券的信用基础不同公司债券的信用基础是该公司的资产状况、经营情况和它的发展空间等，每家公司拥有的资产能力和资源等都不同，发行公司债券的信用基础也有很大区别，往往会有担保机构在背后提高公司债券的信用度。而企业债券，因为发行主体身上有国有的标志，信用基础竟然是政府信用，可信度非常高，信用级别可以说和政府债券一般了。

4、公司债券和企业债券管制程序的不同公司债券的发行管理是注册登记制，只要该公司按照法律规定进行了发债的程序，监管部门就不再可以限制其公司债券的发行。监管部门主要是审查发债公司提交的登记材料的真实合法性及其信用度等。而企业债券，必须由发改委报国务院审批通过后才可以发行。国有企业的经营关系民生，因此对企业债券发行的风险也要控制到最低，规定发行的企业债券的总额不能大于企业净资产的40％，而且必须有银行的担保。但是，一旦审批通过，就不再监管其信用、信息披露、市场行为了。

5、公司债券和企业债券对市场功能的不同公司债券是公司融资的主要方法，使用的非常多，是影响市场发展的重要力量。而，企业债券，由于受到政府的严格管理，发行的数量极少，对市场的作用自然也微乎其微。