瑕疵设立公司的法律效力有：

1、欺诈登记机关取得公司登记，情节不严重的，应当维持其公司登记效力。

只要公司获得营业执照，公司法人人格即应得到维持，公司设立不应当被认定为无效，而是应当进行瑕疵补正。

2、欺诈登记机关取得公司登记，情节严重的，撤销公司登记。

行政行为自撤销之日起失去法律效力，撤销之效力可追溯至行政行为作出之日，公司登记被撤销之后，公司登记之行为自始无效。

3、欺诈登记机关取得公司登记，情节严重的，吊销营业执照。

瑕疵设立之公司的法人人格并未因吊销营业执照而灭失，只是失去了其营业资格，瑕疵公司的设立仍属有效。

一、注册公司登记流程

设立有限责任公司一般应经过如下程序：

1、发起人发起。这是设立有限责任公司的预备阶段，由发起人明确设立公司的意向，并作出必要准备。

2、公司名称的预先核准。在设立有限责任公司时，应向公司登记机关申请拟设立公司的名称的预先核准。只有待名称获得核准后，再进行设立公司的后续行为。

3、制定公司章程。公司章程应当由全体发起人共同商议起草，并经全体股东共同同意通过方可生效。全体股东应当在公司章程上签名、盖章。

4、必要的审批手续。如果设立的有限责任公司是法律、行政法规规定需要报经批准的有限责任公司，则应当按照法律、行政法规的规定履行必要的批准手续。

5、缴纳出资。股东按照公司章程记载的出资额、出资时间、出资方式及时缴纳出资。未按照约定交付出资，按时出资的股东和公司可以追究该股东的责任。

6、申请设立登记。由全体股东指定的代表或者共同委托的代理人向公司登记机关报送公司登记申请书、公司章程等文件，申请设立登记。法律、行政法规规定需要经审批的，还需要提交批准文件。

8、登记发照。公司登记机关对设立登记申请进行审查，对符合公司法规定条件的，予以登记，发给营业执照。营业执照签发之日为有限责任公司成立之日，公司取得法人资格，开始对外开展生产经营活动。

二、企业被吊销后要如何恢复

吊销营业执照，只导致公司失去营业资格，却不影响公司的法人资格。《行政许可法》的规定，行政机关可以依法变更或者撤回已经生效的行政许可。公司登记机关有权依法行使自由裁量权，公司登记机关即使作出吊销公司营业执照的处罚决定，也未必不可以经由法定程序作出变更或撤销行政处罚的决定。企业法人主体资格的消灭，必然要经过行政权才能消灭，但消灭的最终方法是注销而不是吊销。当这个程序依法经过清算，进行注销登记并经公告后，企业的法人资格才归于消灭。如果工商部门是按照法律规定，法定程序吊销的，那么就不能恢复;如果认为工商局吊销营业执照的具体行政行为违法或错误，可以申请复议或行政诉讼，具体行政行为如果撤销，那营业执照就可以恢复。对吊销营业执照不服，可以在处罚决定做出的3天内，书面要求听证，也可以向上一级工商管理部门提起行政复议，也可以在收到决定的3个月内提起行政诉讼。