1、税务机关对个人所得税进行纳税调整后，需要补征个人所得税的，应当补征税款，并依法加收利息。

2、法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》

第八条有下列情形之一的，税务机关有权按照合理方法进行纳税调整：

(1)个人与其关联方之间的业务往来不符合独立交易原则而减少本人或者其关联方应纳税额，且无正当理由；

(2)居民个人控制的，或者居民个人和居民企业共同控制的设立在实际税负明显偏低的国家(地区)的企业，无合理经营需要，对应当归属于居民个人的利润不作分配或者减少分配；

(3)个人实施其他不具有合理商业目的的安排而获取不当税收利益。

税务机关依照前款规定作出纳税调整，需要补征税款的，应当补征税款，并依法加收利息。

一、个人所得税申报方法有哪些

1、申报时所需资料：

根据一个纳税年度内的所得、应纳税额、已缴(扣)税额、抵免(扣)税额、应补(退)税额等情况，如实填写并报送《个人所得税纳税申报表(适用于年所得12万元以上的纳税人申报)》、个人有效身份证件复印件，以及主管税务机关要求报送的其他有关资料。有效身份证件，包括纳税人的身份证、护照、回乡证、军人身份证件等。

2、纳税申报时需要填报的信息：

一般只需填写个人的相关基础信息、各项所得的年所得额、应纳税额、已缴(扣)税额、抵免税额、应补(退)税额。个人的相关基础信息包括姓名、身份证照类型及号码、职业、任职受雇单位、经常居住地、中国境内有效联系地址及邮编、联系电话，如果是外籍人员，除上述内容外，还需填报国籍、抵华日期等信息。

3、纳税申报表的领取：

纳税申报表可以从税务局网站上免费下载，也可以直接到各地方税务机关的办税大厅免费领取。

4、通过兼职取得高收入者的申报：

从两处或者两处以上取得工资、薪金所得的，选择并固定向其中一处单位所在地的主管地税机关申报。

5、申报税务机关的选择：

（1）有任职受雇单位的，向任职、受雇单位所在地主管地税机关申报。

（2）如果有两处或者两处以上任职、受雇单位的，选择并固定向其中一处单位所在地主管地税机关申报。

（3）无任职受雇单位的，年所得项目中有个体工商户的生产、经营所得或者对企事业单位的承包经营、承租经营所得的，向其中一处实际经营所在地主管地税机关申报。