行政、司法、执法部门本来已有鉴定机构，这些鉴定机构和司法鉴定
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这是我国法制进一步健全的表现。我们知道，有些部门（如公安机关），为了自己工作的需要，是设有鉴定机构的。这些鉴定机构，对这些部门的业务活动（例如寻找犯罪嫌疑人，确定破案方向，突破某些疑点等等）是会有很大推进作用的。但是当这些部门把犯罪嫌疑人及其认定的证据提交法庭的时候，被告（辩护）一方，仍可以认为这仅仅是控方提供的材料，不具有法律程序上的公正性。因为这仍然是一种自审自鉴行为，不符合独立、公正的第三方提供鉴定服务的原则。而且，这些单位部门内自设鉴定机构，很难不受上级行政的影响，或者难免受到单位内办案人员的干扰。鉴定意见是贯彻领导意图，接受办案人员的意见还是出自鉴定人的独立见解，很值得怀疑，这会大大降低鉴定结果的公信力。所以，我国规定审判机关，检察机关（除自侦部门外），司法机关都不能进行司法鉴定活动，即“人民法院和司法行政部门不得设立鉴定机构”。前面说过的侦察机关根据工作需要而设立的鉴定机构，只应满足内部业务活动要求，“不得面向社会接受委托从事司法鉴定业务”。而具有面向社会从事司法鉴定业务性质的机构，则由国家司法部门进行登记管理，使其获得合法的地位。
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司法鉴定机构的指定包括以下两种情形： 第一，法庭指派。条件是原、被双方都同意法庭指派，如果成立，法庭可以选择任何一个鉴定机构。 第二，原被双方共同指定。条件是双方都要求去一家指定的鉴定机构去鉴定，如果成立，法庭必须指派这个机构，不能自由选择。
指定司法鉴定机构鉴定的情形： 1、当事人申请司法鉴定的，可以直接委托司法鉴定机构进行鉴定； 2、当事人申请司法鉴定但不能提供鉴定机构的，由法庭直接指定； 3、双方当事人均申请司法鉴定但对司法鉴定机构无法协商一致的，由法庭指定。
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怎么指定司法鉴定机构鉴定呢指定司法鉴定机构鉴定的情形： 1、当事人申请司法鉴定的，可以直接委托司法鉴定机构进行鉴定； 2、当事人申请司法鉴定但不能提供鉴定机构的，由法庭直接指定； 3、双方当事人均申请司法鉴定但对司法鉴定机构无法协商一致的，由法庭指定。
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如何委托司法鉴定机构鉴定的司法鉴定结果指定司法鉴定机构鉴定的情形有： 1、当事人申请司法鉴定但不能提供鉴定机构的，由法庭直接指定； 2、当事人申请司法鉴定的，可以直接委托司法鉴定机构进行鉴定； 3、双方当事人均申请司法鉴定但对司法鉴定机构无法协商一致的，由法庭指定。
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